Esse awk
vai te dar o que você quer.
awk '$6 > 600 { print }' file
$Hostname3: 0x7F2D109F4290 ( 25343) waiting 900 seconds, NSDThread: for I/O completion on disk vd11
$Hostname5: 0x7F2D10A2F830 ( 25392) waiting 750 seconds, NSDThread: for I/O completion on disk vd13
ou por @Kusalananda, esta linha é suficiente
awk '$6 > 600 ' file