Você pode usar a seguinte configuração:
for_window [class=".*"] fullscreen enable
A configuração for_window [CRITERIA] COMMAND
é executada em COMMAND
para cada nova janela correspondente a CRITERIA
. i3 usa PCRE (expressões regulares compatíveis com Perl) para correspondência de padrões, portanto o padrão .*
corresponde a qualquer número de caracteres arbitrários. Significa que corresponde a qualquer nome de classe possível, mesmo os vazios.