Considere configurar o sudo para esse processo em particular e, talvez, configurar o comando específico NOPASSWD: para que você não precise ecoar uma senha em texto puro (muito ruim em qualquer caso). Além disso, há sinalizadores sudo que podem permitir que você requeira ou não um TTY.
Exemplo.
/etc/sudoers.d/mycmd
:
theuser ALL=(fgbs) NOPASSWD: cp fbgs.jar /home/fbgs/server/plugins
my-build-script.sh
:
#!/bin/sh
/usr/bin/sudo -H -u fbgs cp fbgs.jar /home/fbgs/server/plugins