Primeiro de tudo, você deve se certificar de que é realmente o esgotamento do conjunto aleatório que produz o bug em seu software. Você pode executar cat /proc/sys/kernel/random/entropy_avail
para testar a entropia disponível em seu sistema e verificar se ela atinge zero.
Em segundo lugar, AFAIK (eu não testei esses comandos) você pode diminuir o pool de entropia, definindo a variável apropriada em / proc. Para configurá-lo para 32 bits:
echo 32 > /proc/sys/kernel/random/poolsize
ou
sysctl -w kernel.random.poolsize=32