Sim e sim. Os applets em questão são apenas front-ends para processos básicos do sistema operacional. Eles apenas fornecem uma interface gráfica para as ferramentas do sistema, portanto, não deve haver diferença real entre elas. Lembre-se, alguns applets serão melhores que outros, então você pode encontrar funcionalidades faltando lá, mas é só porque quem escreveu o applet não o incluiu, porque não está lá.
Quanto ao gerenciador de login, sim, você pode usar qualquer gerenciador de login para carregar qualquer ambiente de desktop, basta escolher e escolher o que preferir.