Minha máquina teve um problema semelhante após a atualização para o Ubuntu 18.04. Depois de fechar a tampa, o sistema operacional não acordava, mas a luz de fundo se acendia. (Possivelmente não relacionado: parecia que o meu teclado não estava respondendo também, pois o bloqueio de maiúsculas não acendia o LED.)
Encontrei uma correção nas configurações da minha BIOS. Havia uma caixa de seleção para ativar o despertador quando a tampa do laptop é aberta. Foi desmarcada, mas a verificação corrigiu o problema.
$ uname -r
4.15.0-21-lowlatency
$ lsb_release -r
Release: 18.04
$ lscpu
Architecture: x86_64
Model name: AMD PRO A10-8700B R6, 10 Compute Cores 4C+6G
$ dmidecode
BIOS Information
Vendor: HP
Version: N73 Ver. 01.17
Release Date: 11/02/2016