infelizmente o xsane não é capaz de rodar em uma única janela como o GIMP faz.
Mesmo executando-o através do GIMP, ele usará sua própria interface em vez da interface do GIMP.
Neste ponto, há apenas algumas coisas para fazer: - Arme-se de paciência e desvie seu pedido diretamente para o autor ou para o Lista de emails SANE (onde você pode descobrir que a pergunta não é nova) - Se você sabe codificar e tem tempo, você poderia ajudar o autor, fornecendo patches para ele para criar um modo de janela única para xsane.
Atualize a postagem caso decida agir, para que as pessoas que chegam aqui encontrem uma atualização.