Eu estou supondo que o problema real aqui é que o comando que você está tentando executar é o Emacs. Executar o Emacs como root dificilmente é uma boa ideia. O Emacs também substitui um número de pressionamentos de teclas, portanto C-z pode não funcionar simplesmente por esse motivo. Se root já tiver efetuado login, emacs poderá iniciar graficamente na exibição de root . Etc, etc.
Veja o método sudo: da Tramp para editar arquivos usando sudo do Emacs. Por exemplo, para editar /etc/motd , do C-x C-f e digite o caminho como /sudo:root@localhost:/etc/motd .