Para pré-formatar um backup completo do sistema wubi, copie o arquivo root.disk
da sua pasta ubuntu dentro do windows para outro local, se algo ruim acontecer você só precisa substituir o arquivo atual pelo backup e seu sistema estará de volta para o que era no momento do backup.
Você pode até montar o arquivo root.disk
no Ubuntu se quiser restaurar parcialmente apenas alguns arquivos:
sudo mkdir /mnt/rootdisk
sudo mount -o loop <path to share in windows>/root.disk /mnt/rootdisk
Montará seu root.disk
para o caminho /mnt/rootdisk
.