Se você puder pagar alguma RAM, você pode configurar um disco de RAM e deixar seus logs irem para lá:
mount -t tmpfs -o size=200M none /usr/local/apache/domlogs
Além disso, você deve configurar o logrotate para girar os logs a cada minuto / hora / dia / noite / semana / * e excluir os logs antigos. Isso não é exatamente o que você quer, mas deve corrigir o problema, pois a E / S de RAM não diminui a velocidade de seus discos.