Esta parece ser uma oportunidade perfeita para usar a comunicação.
$ comm -1 -3 <(sort file1) <(sort file2)
12344 Dec 10 15:36 /opt/apache-tomcat-6.0.36/webapps/abc/.../test.txt
22677 Dec 3 15:36 /opt/apache-tomcat-6.0.36/webapps/new/abc.txt
-1 e -3 remove todas as linhas exclusivas do arquivo 1 e todas as linhas comuns a ambos.
Por causa do tipo, isso mudará a ordem da saída, mas isso não parece ser uma consideração baseada na pergunta.
Se a entrada já estiver classificada, você pode pular os tipos que geram
$ comm -1 -3 file1 file2