Nada. Diferentes distribuições Linux e o LSB tinham padrões diferentes, portanto ambos estão presentes no CentOS para facilitar a execução de software de diferentes versões. Um é apenas um link simbólico para o outro.
link fornece detalhes sobre o processo de inicialização, mas em última análise, todos os scripts init são quase-mas-não-completamente idênticos nos diferentes sistemas Linux.