Muitos módulos são carregados do initramfs, antes que o sistema de arquivos raiz seja montado. Isso significa que o initramfs contém sua própria cópia da configuração modprobe, portanto, após a edição, você precisa atualizar o initramfs:
sudo update-initramfs -u
fará isso. Observe que apenas atualiza aquele para o kernel atual - você pode especificar argumentos adicionais para atualizar outros (por exemplo, kernels antigos) também.