Isso é feito normalmente usando equivs - criando um pacote trivial. Você cria um pacote cuja única finalidade é (nesse caso) informar ao sistema de gerenciamento de pacotes que você já possui o GRASS GIS instalado. No seu caso, o pacote não teria conteúdo, apenas informações de dependência.
Veja a página do pacote do Ubuntu , página de manual do Ubuntu equivs-build , e um howto aleatório do Ubuntu, Como: criar "pacotes de configuração" com equivs . Para o registro, essa ideia se originou no Debian.