Como executar um programa que tenha sua própria linha de comando dentro de um programa de script de shell

Question

Eu preciso escrever um script de shell para executar automaticamente um conjunto de arquivos por meio de um programa existente ~ 1000 vezes. O programa que estou tentando executá-los é acessado através da linha de comando da seguinte forma, então você carrega os arquivos que você quer que o programa use, digitando "load filetype filename" como segue:

server>./fbat

               *******************************************************
               *                                                     *
               *     *********  * * *          *       *********     *
               *     *          *     *       * *          *         *
               *     *******    *  * *       *   *         *         *
               *     *          *     *     * *** *        *         *
               *     *          *     *    *       *       *         *
               *     *          * * *     *         *      *         *
               *                                                     *
               *          Xin Xu  C1999-2009       v2.0.4Q       *
               *          Program for Population Genetics            *
               *          Harvard School of Public Health            *
               *                                                     *
               *******************************************************

>>load map leprmap.txt

read in 899 markers' info

>>load ped leprped.txt

read in: 899 markers from 16 pedigrees (338 nuclear families,1182 persons)

>>load phe phe_dbpsim2e1.txt

1 quantitative traits have been successfully read
719 persons have been phenotyped

>>trait resid

affection resid** 

>>fbat -v1 -e

(... muita saída aqui)

O arquivo que será alterado em cada execução é phe_dbpsim2e1.txt , cujo nome é incrementado em um número a cada execução. Eu sou capaz de executar o programa a partir de um script, mas uma vez que o programa está aberto, ele não reconhece nenhum dos comandos que estou tentando inserir através do script (isto é, load) e o programa espera que eu insira comandos manualmente . Uma vez que eu saio do programa, todos os meus comandos do script aparecem na tela, então parece que o script que eu escrevi está pausado enquanto o programa está aberto.

Existe uma maneira de inserir comandos no programa depois de aberto sem digitá-los manualmente?

    

Answer 1

Se fbat insistir em obter sua entrada do terminal e você quiser automatizar, a solução é usar expect ( ou pexpect ) . Aqui está um exemplo de um script expect que pode automatizar seu programa:

#!/usr/bin/expect -f
spawn ./fbat
expect ">>"
send "load map leprmap.txt\r"
expect ">>"
send "load phe phe_dbpsim2e1.txt\r"
expect ">>"
send "trait resid\r"

Como não tenho acesso a fbat , o acima, obviamente, não foi testado.

Para instalar o expect em um sistema parecido com o debian, execute:

apt-get install expect