Tente fazer isso:
DEBIAN_FRONTEND=noninteractive apt-get -y install dkms virtualbox-guest-dkms
Veja link
Como posso instalar Adições ao convidado do VirtualBox a partir de um script Bash, de maneira autônoma?
Sempre que eu executo apt-get -y install dkms virtualbox-guest-dkms
do terminal, é apresentada uma caixa de diálogo interativa, existe alguma maneira de contornar ou pré-selecionar as opções de diálogo?
Tente fazer isso:
DEBIAN_FRONTEND=noninteractive apt-get -y install dkms virtualbox-guest-dkms
Veja link