O changeset fe49adb8ec1c (14 de agosto) adicionou trayicon_blink
do ACE, cujo description é: Se False, o Gajim exibirá um ícone de evento estático em vez do ícone de status piscando na área de notificação ao notificar evento.
Você pode esperar por uma versão que inclua essa mudança (eu achei que a 0.15.1 a incluiu) ou execute o Gajim a partir da fonte.
A execução da fonte é trivial, já que você não precisa criar o código. Apenas:
$ hg clone http://hg.gajim.org/gajim/
$ cd gajim
$ ./launch.sh
Não perca os requisitos opcionais de tempo de execução .