Este comando é seguro. Ele pula todos os pacotes com dependências quebradas:
sudo yum update --skip-broken
Você pode verificar todos os pacotes que estão passando pela validação da soma de verificação; sim, é seguro:
rpm -Va --nofiles --nodigest
Suponha que você não possa resolver isso, após alguns dias as dependências aparecerão no repo. Além disso, você pode fazer um relato de erro ao seu fornecedor de distro.