Os arquivos conf no diretório são classificados de forma ascítica e são originados em ordem.
A numeração é uma convenção para garantir que todos os métodos de classificação concordem e facilitar a inserção de novas regras quando se trata de veiculação.
Não edite o arquivo limits.conf, já que agora ele atrai os erros, já que é uma política ruim em geral (as razões não eram tão óbvias naquela época).