Qualquer repositório noturno pode vir com algum risco de quebra (em termos de código), mas quanto aos seus dados - ninguém o está lendo se você estiver usando o mesmo serviço que o que você usaria com o Ubuntu One.
O motivo pelo qual você está recebendo um erro no Apt é porque você não adicionou gpg para o repositório (o que eu sugiro que você faça, mas não é grande coisa).