Não tenho certeza se é uma opção padrão ou uma extensão do GNU, mas se o seu uniq
tem um sinal -w
:
-w, --check-chars=N
compare no more than N characters in lines
Então
sort file | uniq -D -w12
abc100200300 abmen
abc100200300 arcxi
ou redirecionado para um novo arquivo
sort file | uniq -D -w12 > newfile