O suporte para IPv6 é implementado no Linux, mas você ainda pode ter que fazer duas coisas:
- Verifique se a funcionalidade Ipv6 está ativada, por exemplo, se seu kernel possui módulos relacionados ao IPv6 carregados ou compilados.
- Quando relevante, saiba quais são as ferramentas que são versões específicas do IPv6 e verifique se essas versões estão disponíveis, por exemplo: para ping em redes IPv4 (como a internet a partir de hoje) você usa 'ping', mas para ping usando IPv6, confie no ping6.
As distribuições do Linux com as quais trabalhei parecem ter suporte a IPv6 já configurado, mas eu recomendo que você verifique sua caixa do Linux. Por exemplo, verifique se você tem um comando ping6 e verifique se o comando 'ifconfig' lista um ou mais endereços 'inet6 addr'.
(Para algumas distribuições, você pode ter que incluir explicitamente suporte para IPv6, como o Gentoo, por exemplo. OTOH, no Gentoo você tem que habilitar explicitamente qualquer coisa que você quer incluir)