Lá atrás, quando a Terra era jovem, as pessoas apontavam que, se você tem um número constante de bits por polegada e um número constante de rpm, o "exterior" de um disco rígido é ligeiramente mais rápido do que o interior. Mas atualmente, há tantas camadas de abstração entre você e a camada física que eu não tenho certeza se você pode colocar uma partição lá se você quiser. Então eu não me preocuparia muito do ponto de vista do desempenho.
Se você precisar de mais espaço, remover a partição de troca e aumentar a partição antes disso parece ser uma mudança segura, então trocar depois de casa pode ser uma boa idéia.
Finalmente, você não precisa de uma partição separada, você também pode ter uma arquivo de troca , que pode ter um pequeno impacto no desempenho, mas em uma máquina desktop com 2G? 4G? de RAM, você pode nunca usar swap em primeiro lugar.