Basta pesquisar o arquivo dentro do script:
. /path/to/file.conf
Mas observe que o arquivo .conf deve ter uma sintaxe sh válida, porque . interpreta o conteúdo do arquivo fornecido como sh code.
( . é o comando POSIX / portable para shells do tipo Bourne. Para (t)csh shells, use source . bash , ksh e zsh suportam ambos embora com diferenças sutis para alguns )