Ao modificar a tabela de partições, fdisk geralmente retorna a seguinte mensagem de erro:
WARNING: Re-reading the partition table failed with error 16: Device or resource busy.
O kernel ainda usa a tabela antiga. A nova tabela será usada na próxima reinicialização.
Existe algum método para evitar a reinicialização?
Existe uma solução usando o partprobe de um software separado. Mais informações aqui: link
Depois de usar seu comando fdisk e ter feito suas modificações, faça um partprobe ou partprobe /dev/sdx e ele deve informar o kernel da alteração sem reinicialização.