Tanto quanto eu posso ver, isso seria muito improvável.
Primeiro, o vírus precisaria ser distribuído como um binário Linux - ou qualquer plataforma cruzada - e ser inteligente o bastante para encontrar uma partição do Windows. Isso é muito fácil de fazer (você pode apenas procurar por uma pasta Windows
).
Além disso, o vírus precisaria alterar o registro do Windows ou outro arquivo de configuração do Windows para se habilitar. Embora a API do Windows permita fazer essas alterações, um vírus que seja executado no Linux precisaria implementar seus próprios procedimentos para executá-las.
Por fim, um spyware no navegador da Web do Linux não afetará o Windows. Provavelmente, o spyware seria instalado sob o diretório /home
(desde então, ele não precisa ser o root), que não pode ser acessado pelo Windows (sistemas de arquivos diferentes).
Tudo isso seria mais trabalho (para o desenvolvedor de vírus) para muito pouco ganho: neste ponto, pode ser mais lucrativo para ele direcionar o lado do Linux.