Algum software específico pode ser configurado com --program-suffix=-my-version-suffix . Talvez seja necessário personalizar alguns dos outros diretórios, mas se você deixar o --prefix para o padrão ( /usr/local ), isso não colidirá com o pacote da distro em /usr .
No caso geral , a única distro que tenta permitir a co-instalação de versões arbitrárias é Nix , embora O Gentoo tenta mais pacotes do que a maioria das distros se preocupa (embora para o Bison ele só permita uma versão de cada vez - pelo menos ela oferece uma escolha embora).
Observe, no entanto, que se o código-fonte quebrar com versões mais recentes do bison, isso geralmente significa um problema simples com o código-fonte. Geralmente, há alguns %option (ou --argument ) que podem consertá-lo.