Ok, isso funcionou para mim:
- Kill Docky (
killall docky
) - Abra o nautilus (ou qualquer navegador de arquivos que você use)
- Clique com o botão direito em uma pasta
- Selecione "Abrir com outro aplicativo ..."
- Certifique-se de que "Lembre-se de que esta aplicação para arquivos 'pasta'" está marcada
- Clique em Abrir
- Reinicie o Docky
Eu estava recebendo um erro de arquivo não encontrado. Demorei um pouco, mas percebi que estava tentando abrir as pastas com o Rythmbox. O meu pode ser apenas uma situação muito estranha, mas eu diria que vale a pena um tiro apenas no caso.