Em suma, e assumindo uma cota de disco suficiente, nenhuma.
A maioria dos softwares (note o qualificador) hoje em dia usa as ferramentas automake
para ajudar a configurar-se em tempo de compilação; se o software que você está tentando instalar fizer isso, basta informar configure --prefix=~
e ele instalará todos os softwares, arquivos de configuração e bibliotecas em seu diretório pessoal onde você tem acesso de gravação.
Note que isso rapidamente criará uma bagunça completa e geralmente é recomendado que você peça ao administrador do sistema para instalar o software que você precisa depois de explicar por que você precisa - o matplotlib certamente soa como algo que os estudantes de astrofísica poderiam usar. p>