A configuração está correta. Autologin deve registrar um usuário em sua sessão anterior, não é um parâmetro. No entanto, há um bug no gdm3 que o impede de funcionar como esperado.
O bug é corrigido pelo autor: link . É lançado no GNOME 3.25.3, mas o Stretch está em 3.22.3. Felizmente o patch se aplica de forma limpa em 3.22.3.
Eu criei um gdm3 corrigido.
Os pacotes corrigidos corrigem o erro. Eu posso me autologar com o GNOME no Wayland sem qualquer alteração na configuração.