Edite smb.conf e encontre uma linha como esta,
smb ports = 445 139
altere essa porta padrão para
smb ports = 2222 2000
Em seguida, reinicie o servidor samba. Agora o servidor samba deve estar escutando nas novas portas que você mencionou.
Para mais informações sobre como personalizar o servidor samba, clique aqui para documentação.
N.B. : Use o número da porta acima de 1024, pois eles são reservados para fins do sistema. Espero que ajude!