Se você tiver um processador de 64 bits, uma alternativa seria tentar um kernel de 64 bits.
De acordo com este white paper RedHat , um servidor típico experimenta cerca de 1% de desempenho hit e outras tarefas sofreram um impacto no desempenho de 0% - 10%.
Além de ter mais memória disponível, ativar o PAE significa que você tem um bit NX, o que pode aumentar a segurança.