Experimente parallel -X
. Conforme escrito nos comentários, a sobrecarga de iniciar um novo shell e abrir arquivos para armazenamento em buffer para cada argumento é provavelmente a causa.
Esteja ciente de que o GNU Parallel nunca será tão rápido quanto xargs por causa disso. Espere uma sobrecarga de 10 ms por trabalho. Com -X, essa sobrecarga é menos significativa à medida que você processa mais argumentos em um trabalho.