Eu tive o problema exato depois de usar a escala com xrandr, embora com uma configuração ligeiramente diferente. Estranhamente, o que ajudou foi a primeira seção no link . Ou seja,
"No entanto, para aproveitar algumas opções de driver, você precisará criar um arquivo de configuração do Xorg semelhante ao abaixo:"
/etc/X11/xorg.conf.d/20-intel.conf
Section "Device"
Identifier "Intel Graphics"
Driver "intel"
EndSection
Isso provavelmente é relevante apenas se você estiver usando gráficos da Intel (e não em uma GPU dedicada)