Se você ainda não tiver um, crie um arquivo em seu diretório pessoal chamado .Xresources para armazenar suas preferências para vários programas X. Anexar uma linha ao arquivo, como
xterm*font: *-fixed-*-*-*-18-*
Isso informa xterm para usar a fonte 'fixa' no tamanho 18.
A partir daqui, você pode reiniciar X ou executar xrdb -merge ~/.Xresources em um terminal para incorporar as alterações feitas. Todos os novos xterm s agora devem ter a fonte alterada.
Se você executar man xterm e ir para a seção RECURSOS, poderá encontrar muitas opções xterm configuráveis adicionais.