Minha configuração no Orange Pi Zero para UART no kernel principal:
overlay_prefix=sun8i-h3
overlays=usbhost2 usbhost3 uart1 uart2
Ambas as UARTs funcionam bem.
$ uname -a
Linux orangepizero 4.13.16-sunxi #20 SMP Fri Nov 24 19:50:07 CET 2017 armv7l armv7l armv7l GNU/Linux