O uso de arquivos rsync
simples é lido da mesma maneira que qualquer aplicativo leria um arquivo. Isso pode levar a cópias com dados inconsistentes. A melhor maneira de evitar cópias inconsistentes é usando instantâneos LVM, que impedirão alterações nos dados durante a cópia.
Da minha experiência, obter dados inconsistentes é raro, provavelmente devido à forma como os buffers do kernel gravam. Somente arquivos muito gravados, como arquivos de banco de dados, resultam em corrupção.