Da minha experiência de execução de um reiserfs criptografado com informações privadas, você não deve colocar isso em um sistema de arquivos com o diário como o ext3. Voltei do ext3 para o arquivo em uma partição ext2 depois que precisei restaurar de um backup.
Ao longo dos anos (tive esse arquivo por 5 anos), tive que executar a recuperação várias vezes e, quando hospedado no ext3, esse era o tempo somente que o reiserfsck não pôde recuperar. Eu acho que foi porque ext3 fez uma recuperação que confundiu os internos do disco criptografado.
Eu nunca tentei um sistema de arquivos não-journal em um sistema de arquivos journal (por exemplo, arquivo ext2 criptografado no reiserfs) para mim o importante (isto é, dados criptografados devem ser registrados).
Eu ainda estou rodando o reiserfs, nunca usei o ext4 para isso (mas estou considerando o btrfs, só preciso checar se está estável o suficiente)
Se você colocar seu homedirector lá, esteja preparado para que isso pareça um pouco lento, eu não acho que qualquer refinamento dos parâmetros poderia ter ajudado isso, e eu não acho que os ext4 irão influenciar muito as coisas, dado que A criptografia é uma penalidade de desempenho em todas as direções.