O BTRFS e o ZFS fornecem mecanismos para fazer backup de "blocos alterados" entre os instantâneos.
Isso significa que você obteria um instantâneo FULL inicial + backup do seu volume. Depois, você pode criar um segundo instantâneo e exportar as diferenças entre os dois; que são efetivamente apenas os blocos alterados.
Existem também soluções de bloco alterado na solução Ceph / Rados Clustered Storage. Onde os dispositivos de bloco RBD também podem ser instantâneos e diferenciados.