O que você precisa é de um intermediário na forma de um editor de texto muito simples que não seja usando o Qt Toolkit. Os widgets do Qt incluirão as informações de formatação em uma operação de recortar / copiar e, se o widget do Qt que for colado aceitar a formatação, a formatação será exibida. Eu experimentei isso em meus próprios aplicativos PyQt. No entanto, se o texto é colado em um cliente X11 que aceita apenas texto sem formatação, a formatação não será colada. Você pode então selecionar / copiar do intermediário e colar em Anki.
Nota: Pode ser possível usar outro aplicativo Qt, pois isso depende de como o QtextEdit está configurado no aplicativo, embora isso dependa de tentativa e erro ao determinar o aplicativo que você precisará para servir como intermediário.