Uma desvantagem para twm é que ele não parece implementar dicas de gerenciador de janelas estendidas (EWMH) Isso não é necessário para executar aplicativos contemporâneos, mas muitos deles podem explorar isso (e acredito que as bibliotecas GTK e Qt também podem) - por exemplo, o "modo de tela cheia" exigirá isso em muitos casos e aplicativos que se organizam em maneiras particulares usando várias janelas podem não ser organizadas sem ele.
No entanto, o fvwm , um derivativo de twm quase tão antigo, mas que continua sendo desenvolvido ativamente, implementa grande parte do padrão EWMH.