Eu uso o fdisk. antes de aplicar isso eu recomendo trabalhar com um live CD ou USB e fazer o backup de seus dados.
Primeiro, verifique se alguma partição inicializável está presente como em meu sistema, e que "/ dev / sda1" é a partição inicializável:
fdisk -l /dev/sda
Disk /dev/sda: 500.1 GB, 500107862016 bytes
255 heads, 63 sectors/track, 60801 cylinders, total 976773168 sectors
Units = sectors of 1 * 512 = 512 bytes
Sector size (logical/physical): 512 bytes / 512 bytes
I/O size (minimum/optimal): 512 bytes / 512 bytes
Disk identifier: 0x00003256
Device Boot Start End Blocks Id System
/dev/sda1 * 2048 959991807 479994880 83 Linux
/dev/sda2 959993854 976766975 8386561 5 Extended
/dev/sda5 959993856 976766975 8386560 82 Linux swap / Solaris
Se não houver nenhuma partição de inicialização, faça assim com o login root:
fdisk /dev/sda
Command (m for help): m
Command action
a toggle a bootable flag
b edit bsd disklabel
c toggle the dos compatibility flag
d delete a partition
l list known partition types
m print this menu
n add a new partition
o create a new empty DOS partition table
p print the partition table
q quit without saving changes
s create a new empty Sun disklabel
t change a partition's system id
u change display/entry units
v verify the partition table
w write table to disk and exit
x extra functionality (experts only)
Command (m for help): a
Partition number (1-5):
Você tem que digitar 1 se quiser inicializar a partição 1 ou depois 2 se quiser tornar a segunda partição inicializável, etc ...
e aply a modificação com "w" como este
Command (m for help): w
Para modificar a tabela do seu disco e tornar a partição desejada inicializável.
Na esperança de que ajuda