umount
é suficiente. Depois disso, é completamente seguro desconectar seu dispositivo.
Cito de esta resposta :
Unmounting is sufficient for USB/eSATA/etc. storage devices.
Se você tem muitos dados em cache a serem gravados na unidade, você pode usar este comando:
e, em seguida, observe o progresso com:
watch grep -e Dirty: -e Writeback: /proc/meminfo