Não é assim que os certificados funcionam. Você não pode gerar uma chave privada para um certificado SSL existente. Primeiro você gera o par de chaves (privado + público), então você gera um CSR (contendo sua chave pública) que você encaminha para a CA (Comodo, neste caso) que lhe fornecerá o certificado para instalar em seu servidor.
Talvez a chave privada ainda esteja em algum lugar do sistema - deve ser um arquivo .key
. Qual comando você usou para fazer o CSR? Observe que, se você não tiver mais a chave privada, esse certificado será inútil e você precisará solicitar uma nova.
Editar: possível duplicata de Apache - gerar privados chave de um arquivo .crt existente