Existem alguns gerenciadores de arquivos que também gerenciam os ícones da área de trabalho, mas o Thunar não é um deles.
A área de trabalho do Xfce usa o Xfdesktop para exibir os ícones da área de trabalho, isso depende do Thunar.
Como alternativa, você pode usar iDesk , que não tem dependências para nenhum dos ambientes de desktop mais importantes, mas precisa ser configurado manualmente.
Alguns dos gerenciadores de arquivos que podem exibir ícones da área de trabalho são
Todos devem trabalhar com o Openbox.