Isso depende inteiramente e completamente do método de transferência.
rsync preservará as permissões com -p , a propriedade com -o (usando o ID numérico somente se você passar --numeric-ids ). -a combina -rlopt , a menos que você a negue com --no-o ou --no-p .
scp normalmente não preservará permissões, mas será válido se você passar -p .
cp tem aproximadamente os mesmos sinalizadores ( -p para permissões, -a para tudo e recursing).
tar tem o sinalizador -p também.
cpio sempre preservará as permissões.