Todo o resto sendo padrão, 0550 e 0700 não têm diferenças práticas para /root
: o diretório tem o grupo "root" para que as permissões de grupo não façam diferença, e se o usuário "root" recebe permissão de escrita é irrelevante porque ele é root mesmo assim.
A diferença entre 2775 e 0775 para /usr/local
também não costuma fazer diferença: o bit pegajoso para diretórios garante que apenas o criador dos arquivos possa excluí-los, mas as permissões padrão só permitem que o usuário "root" crie arquivos de qualquer maneira, quem também é o único usuário com permissão para excluí-los. O bit pegajoso se tornaria relevante se você permitir que um usuário não raiz crie arquivos ou subdiretórios nele.
Portanto, essas duas escolhas representam apenas filosofias diferentes e geralmente não oferecem diferenças práticas.
Sinto muito não ter conseguido apontar padrões relevantes aqui, exceto para dizer que não há nenhum. A forma como você configura as permissões de arquivo depende de você, o administrador do sistema, e as distribuições têm sua própria maneira de fazer isso para você, que equilibra a segurança e a utilidade.