O mesmo acontece no Ubuntu 18.04.
Se o diretório inicial do usuário não estiver na montagem /home (ou / ), não será possível trabalhar com snap . Meu HOMEDIR estava em outro disco SSD local, mas como ele não estava montado em /home , todos os pacotes instalados pelo snap estavam falhando.
Como a Canonical está se movendo para suportar snap, você terá que perder esse tipo de coisas legais, como o HOMEDIRs em outros sistemas de arquivos, montado pelo NFS, etc.
Talvez o snap seja mais flexível no futuro, mas não é uma prioridade: link
A solução agora é remover snap e instalar coisas de *.tar.gz ou *.deb packages.