O FreeBSD tem seu próprio ssh no Sistema Básico (não empacotado) . O mesmo vale para ssl.
Estes dois componentes que você mencionou são atualizados com o freebsd-upgrade.
Sua observação está correta de que tudo que está instalado com o pkg está em / usr / local. E / usr / bin e / bin etc. são reservados para os componentes básicos do sistema.
Mas é possível instalar esses dois pacotes a partir de ports / pkgng também. Eu suponho que você não fez isso, é por isso que eles não são visíveis no pacote.
Portanto, não há como gerenciá-los como pacotes com o comando pkg. Especialmente os componentes ssl que você não deseja excluir, pois são usados para muitas coisas no sistema.