Coisas para tentar.
1. O caminho existe?
Eu sei que parece bobo, mas certifique-se de que o diretório /apachelogs/data
exista. Também verifique se o arquivo existe, /apachelogs/data/file
e se você tem permissões para manipulá-lo.
2. Experimente os comandos de um shell
Eu confirmaria que os comandos acima podem funcionar diretamente em um shell antes de tentar executá-los no Python.
Exemplo
Tente o seguinte:
$ cd /apachelogs/data
$ touch foobar
Agora adicione o atributo estendido:
$ setfattr -n user.foo -v bar foobar
$ getfattr -d foobar
# file: foobar
user.foo="bar"